Das Museum liegt am südlichen Stadtrand von Neapel, im Stadtteil San Giovanni a Teduccio an der Grenze zu den Nachbargemeinden San Giorgio a Cremano und Portici, unmittelbar am Haltepunkt Pietrarsa-S. Giorgio a Cremano an der Bahnstrecke Neapel–Portici–Salerno, der ersten Eisenbahnstrecke in Italien, die am 3. Oktober 1839 eröffnet wurde. Mit dem Bahnhof ist es durch eine Unterführung verbunden.
Koordinaten um Nationales Eisenbahnmuseum Pietrarsa mit dem Navigationssystem zu erreichen.
Längengrad: 14.3205
Breitengrad: 40.8217
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